本系之教育目標是以培育國家社會所需之高級化學人才為主，教學內容除著重化學專業領域知識的傳授外，並鼓勵同學動手做實驗，手腦並用，以期與工業界相結合；此外更強調全人教育之培養，加強倫理教育，以替國家作育英才為職志。

延續大學部課程，進而區分有機化學、無機化學、材料化學、分析化學和物理化學五個領域。主要是為工業界、學術界培養學養精湛、且具創造能力之科學家，能有效的應用化學知識來解決社會問題及增進人類福祉。